switch to English

Contract CNCSIS PN II - IDEI 1138 / 2009

MECANISME COMPLEXE DE SEMNALIZARE CELULARA PRIN INTERMEDIUL IONILOR DE CALCIU IN CONDITII NORMALE SAU DE STRESS OXIDATIV - ROLUL IN PROLIFERARE, APOPTOZA SI IN CUPLAJUL EXCITATIE/CONTRACTIE MUSCULARA Clasificare CNCSIS: Subcomisia 6A, domeniu: 20

Rezumatul proiectului Echipa de cercetare a proiectului Gradul de implicare a tinerilor cercetatori Obiective si activitati si gradul de realizare Rezultatele obtinute Articole publicate

1. Rezumatul proiectului (romana, engleza).

2. Echipa de cercetare a proiectului
Titulatura membrilor echipei de cercetare la momenul semnarii contractului:

• Conf. Univ. Dr. Irina Baran (director)
• Prof. Univ. Dr. Constanta Ganea
• Dr. Anca Popescu
• Dr. Maria-Magdalena Mocanu
• Drd. Adrian Iftime (devenit intre timp doctor in stiinte medicale)
  
• Student Raluca Ungureanu

3. Gradul de implicare a tinerilor cercetatori:

Tineri cercetatori (<35 ani) in formare: Anca Popescu, Adrian Iftime, Raluca Ungureanu(a se vedea mai jos si lista de publicatii, la care acestia au contribuit)

• 2009: 52%

4. Obiective si activitati si gradul de realizare:

• 2009
  • Obiectiv 1. Modelarea procesului de eliberare a ionilor de calciu in celule neexcitabile
    • 1.1.Documentare asupra datelor si observatiilor experimentale din literatura, precum si a formalismelor de modelare existente.
    • 1.2 Elaborarea si implementarea algoritmilor de calcul; Testarea metodei prin simulari numerice; Optimizarea parametrilor modelului.
    • 1.3. Efectuarea de simulari si calcule numerice pentru un numar mare de evenimente de eliberare de calciu; Deducerea proprietatilor semnalelor de calciu pentru indicatori fluorescenti diferiti; Comparare cu datele experimentale existente. Deplasare masuratori Catania.
    • 1.4. Comunicarea rezultatelor – publicare web, seminar stiintific
  • Grad de realizare: total
    
    
  • Obiectiv 2. Elaborarea si optimizarea metodelor si protocoalelor experimentale
    • 1.2.Documentare asupra datelor si observatiilor experimentale din literatura.
    • 2.2. Realizarea unor masuratori preliminare de proliferare, viabilitate in celule Jurkat. Achizitie componente spectrofluorimetru.
    • 2.3. Realizarea unor masuratori preliminare prin metoda spectrofluorimetrica a concentratiilor intracelulare de Ca2+, stagii de lucru colaborare Catania.
    • 2.4. Prelucrarea datelor experimentale si interpretarea rezultatelor. Optimizarea protocoalelor experimentale.
    • 2.5. Comunicarea rezultatelor – publicare web, seminar stiintific
  • Grad de realizare: total
    
    
  • Obiectiv 3. Estimarea parametrilor impliciti ai semnalelor de calciu observate in celule neexcitabile
  • 3.1. Extragerea valorilor parametrilor observabili pentru toate semnalele de calciu simulate.
  • 3.2. Obtinerea functiilor de dependenta a parametrilor observabili de parametrii impliciti ai semnalului. Achizitie componente spectrofluorimetru. Consumabile, servicii punere la punct laborator culturi celulare.
  • 3.3. Calculul teoretic al distributiilor marimilor observabile asociate cu un numar mare de evenimente.
  • 3.4. Compararea distributiilor teoretice cu cele observate experimental. Estimarea valorilor caracteristice eliberarii in vivo (curent ionic mediu, durata medie de eliberare etc.).
  • 3.5. Elaborarea metodei de estimare a parametrilor impliciti din datele imaginilor de fluorescenta.
  • 3.6. Diseminarea rezultatelor. Publicare web. Articol stiintific.
  • Grad de realizare: total

5. Rezultatele obtinute (detaliate pe etapele de desfasurare a contractului):

• Etapa 1 (unica, 2009)
  • Rezultate (Raport stiintific)
• Etapa 2 (unica, 2010)
• Rezultate (Raport stiintific)
• Etapa 3 (unica, 2011)
• Rezultate (Raport stiintific)

6. Articole publicate:

• A) Publicatii (in reviste internationale cotate ISI):
  
  
• Baran, I; Ganea, C; Ungureanu, R, I.T. Tofolean, Signal mass and Ca2+ kinetics in local calcium events: a modelling study, Journal of Molecular Modeling, 2011, acceptat, DOI: 10.1007/s00894-011-1104-6, [ISI - factor de impact 1.871]
  
  
• Baran, I, C. Ganea I. Ursu, V. Baran, O Calinescu, A. Iftime, R. Ungureanu, I.T. Tofolean, Fluorescence properties of quercetin in human leukemia Jurkat_T cells, Rom. J. of Physics, Volume 56, no. 3-4, 388-398, 2011, [ISI - factor de impact 0.340]
  
  
• Ionescu, D., Ganea, C., A study of quercetin effects on phospholipid membranes containing cholesterol using Laurdan fluorescence, European Biophysics Journal with Biophysics Letters, 2011, trimis, în revizie, [ISI - factor de impact 3.101]
  
  
• Baran I, Ganea C, Scordino A et al., Effects of menadione, hydrogen peroxide and quercetin on apoptosis and delayed luminescence of human leukemia Jurkat T-cells. Cell Biochemistry and Biophysics, 58: 169-179 (2010) [ISI - factor de impact 3.337] (link)
  
  
• Baran I, Iftime A, Popescu A,  Diffusion - convection effects on drug distribution at the cell membrane level in a patch-clamp setup. BioSystems 102: 134-147 (2010) [ISI - factor de impact 1.267] (link)
  
  
• Irina Baran, Anca Popescu: „A model-based method for estimating Ca2+ release fluxes from linescan images in Xenopus oocytes”, Chaos vol. 19(3): 037106, pp.1-15, sept. 2009 [ISI - factor de impact 2,152] (link_ISI)(web-link)
  
  
• Irina Baran, Constanta Ganea, Virgil Baran: „Numerical studies on the activity of the muscle calcium channel”, Romanian Reports in Physics vol. 61(3): 547-554, sept. 2009 [ ISI - factor de impact 0,33] (link_ISI) (web-link)
  
  
  
• B) Articole publicate in baze de date internationale (BDI) recunoscute:
  
  
• Popescu, A., A. Iftime, C. Ganea, Possible protective effect of quercetin against heavy metals insertion in lipid bilayers, Rom. J. Biophys. (Index Copernicus) 2011 21(3):167-178
  
  
• Baran, I., C. Ganea, et al., Apoptosis and delayed luminescence of human leukemia Jurkat-T cells after proton-irradiation and treatment wth oxidants agents and flavonoids, Activity Report Istituto Nazionale Di Fisica Nucleare Laboratori Nazionali Del Sud, acceptat; Edit. Arti Grafiche Le Ciminiere Catania, Italia; ISSN: 1827-1561
  
  
• Baran, I., C. Ganea, et al., Effects of the mitochondrial respiration inhibitor, rotenone, on apoptosis, clonogenic survival and delayed luminescence of human leukemia Jurkat T-cells, Activity Report Istituto Nazionale Di Fisica Nucleare Laboratori Nazionali Del Sud, acceptat; Edit. Arti Grafiche Le Ciminiere Catania, Italia; ISSN: 1827-1561
  
  
• Baran I, Ganea C, Scordino A et al. (2010) Correlation between delayed luminescence and oxidative stress-induced apoptosis in human leukaemia Jurkat T-cells. Activity Report Istituto Nazionale Di Fisica Nucleare Laboratori Nazionali Del Sud, pp. 242-245; Edit. Arti Grafiche Le Ciminiere Catania, Italia; ISSN: 1827-1561
  
  
• Baran I, Ganea C, Scordino A et al. (2010) Apoptosis, cell cycle and delayed luminescence of human leukemia Jurkat T-cells under proton-irradiation and oxidative stress conditions. Activity Report Istituto Nazionale Di Fisica Nucleare Laboratori Nazionali Del Sud, pp. 246-249; Edit. Arti Grafiche Le Ciminiere Catania, Italia; ISSN: 1827-1561
  
  
• Adrian Iftime, Anca Popescu, Constanta Ganea (2010) Effects of epigallocatechin gallate on artificial lipid membranes. Romanian Journal of Biophysics, 20(4) 323-334; indexata in IndexCopernicus; ISSN: 1220-515X
  
  
• Vincenza Barresi, Irina Baran, Constanta Ganea, Eva Katona, Nicolò Mussoe, Carmela Capizzi, Maria-Magdalena Mocanu, Ioan Ursu, Virgil Baran, Giacomo Cuttone, G.A.P. Cirrone, Salvatore Tudisco, Daniele F. Condorelli. High resolution genome-wide analysis of genetic markers and retrospective biological dosimetry of absorbed radiation, 2009. Activity Report Istituto Nazionale di Fisica Nucleare Laboratori Nazionali del Sud, pp. 236-240. Edit. Arti Grafiche Le Ciminiere Catania, Italia, ISSN: 1827-1561 (abstract) (web-link)
  
  
• Irina Baran, Constanta Ganea, Agata Scordino, Francesco Musumeci, Salvatore Tudisco, Simona Privitera, Rosaria Grasso, Vincenza Barresi, , Daniele F. Condorelli, Virgil Baran, Eva Katona, Maria-Magdalena Mocanu, Marisa Gulino. Mihaela Surcel, Cornel Ursaciuc. Effects of menadione and quercetin on apoptosis and delayed luminescence of human leukaemia Jurkat T cells, 2009. Activity Report Istituto Nazionale di Fisica Nucleare Laboratori Nazionali del Sud, pp. 240 - 244. Edit. Arti Grafiche Le Ciminiere Catania, Italia, ISSN: 1827-1561 (abstract) (web-link)
  
  
• A. Popescu, I. Baran, A. Morega, C. Ganea. Drug delivery in a patch-clamp setup: Computational models of concentration distribution on the cell membrane. Comunicare orală şi studiu in extenso, Seventh Workshop on Mathematical Modelling of Environmental and Life Sciences Problems, Constanta Nov. 2008. Book: Series on Mathematical Modelling of Environmental and Life Sciences Problems. Proceedings of Workshops 2009 (Editura Academiei Române) ISBN: 973-27-1113-2 (web-link)

• C) Conferinte stiintifice cu comitet de program (peer-review), in 2011:
  
  
• “Effects of the mitochondrial inhibitor, rotenone, on aptoptosis, clonogenic survival and delayed luminescence of human leukemia Jurkat T-cells”.
  Autori: Irina Baran, Maria Magdalena Mocanu, Raluca Ungureanu, Constanta Ganea, Simona Privitera, Agato Scordino, Vincenza Baressi, Francesco Musumeci, Rosaria Grasso, Danielle F. Condorelli, Virgil Baran
  Prezentare orala la 17th International Biophysics Congress (IUPAB 2011, Beijing) şi a apărut în Proceedings-ul congresului: Abstract, oct. 30th-nov. 3d, Beijing, China, www.17ibc.org, S26-O4, p. 163.
  
  
• “Quercetin modulates Hofmeister series anion effect on phase transition of DMPC liposomes”
  Autori: Diana Ionescu, Adrian M. Iftime, Constanta Ganea.
  Prezentare poster la 17th International Biophysics Congress (IUPAB 2011, Beijing) şi a apărut în Proceedings-ul congresului: Abstract, oct. 30th-nov. 3d, Beijing, China, www.17ibc.org, P18-20, p. 433.
  
  
• “Investigation of epigallocatechin gallate effects on phase transition temperature of DMPC liposomes in presence of Hofmeister series anions”
   Autori: Adrian M. Iftime, Diana Ionescu, Domnica Barbu, Ines Agiu, Constanta Ganea.
  Prezentare poster la 17th International Biophysics Congress (IUPAB 2011, Beijing) şi a apărut în Proceedings-ul congresului: Abstract, oct. 30th-nov. 3d, Beijing, China, www.17ibc.org, P18-21, p. 434.
  
  
• „Fluorescence properties of quercetin in human leukemia Jurkat T-cells”.
  Autori: Irina Baran, Constanta Ganea, Ioan Ursu, Virgil Baran, Octavian Calinescu, Adrian Iftime, Raluca Ungureanu, Ioana Teodora Tofolean.
  Prezentare poster la congresul international 8th EBSA European Biophysics Congress, Budapesta, Ungaria, AUG 23-27, 2011, şi a apărut ca rezumat în Web of Science: EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS  Volume: 40  Supplement: 1, Pages: 69-69, Publicat: aug 2011
  
  

Ultima actualizare: decembrie 2011.
Acest site este actualizat la finalizarea fiecarei etape din desfasurarea proiectului si in momentul publicarii rezultatelor, articolelor, etc. Structura site-ului respecta recomandarile structurale ale CNCSIS (aprilie 2010)